Mikael Khachatryan est docteur en droit (PhD) et professeur associé. Il est titulaire de masters de l'Université Paris VIII (Vincennes-Saint-Denis) en France et du Collège d'Europe à Bruges en Belgique. Il s'est également perfectionné en politiques publiques et administration à la prestigieuse Fletcher School de l'Université Tufts, aux États-Unis. Il a également été chercheur Fulbright au Center for Public Health Law Research de l'Université Temple (États-Unis).
Il a travaillé au Département des relations avec la CEDH du ministère de la Justice d'Arménie et a été membre du Parlement européen de la santé à Bruxelles. De 2016 à 2022, il a dirigé le Département de la coopération internationale au sein du bureau du Défenseur des droits de l'homme d'Arménie. Depuis le 10 mars 2025, il a occupé le poste de conseiller du président du Comité des revenus d'État de l'Arménie, principal responsable des relations avec l'Union européenne, avant d'être nommé par le Premier ministre en tant qu'Attaché douanier de l'Arménie auprès de l'Union européenne et de l'Organisation mondiale des douanes.
Également chercheur et enseignant, il est l'auteur d'une cinquantaine de publications scientifiques.